As origens algorítmicas da vida
https://elohim.catsboard.com/t347-as-origens-algoritmicas-da-vida
Em Inglês:
https://reasonandscience.catsboard.com/t3061-the-algorithmic-origins-of-life
Chance de encontrar uma mensagem escrita em uma nuvem no céu: "Jesus te ama" aleatoriamente, é como o DNA criando seu próprio software e, sobre ele, escrevendo um algoritmo complexo para fazer uma proteína por acidente.
1. Algoritmos, prescrição de instruções funcionais, programação digital, uso de símbolos e sistemas de codificação são abstratos e não físicos, e sempre se originam do pensamento - da atividade consciente ou inteligente.
2. A informação genética e epigenética é caracterizada por conter informação prescritiva codificada, que resulta em resultados funcionais devido à sequência complexa específica certa de códons tripletos e, finalmente, o sequenciamento traduzido de blocos de construção de aminoácidos em cadeias de proteínas. O sequenciamento de nucleotídeos no DNA também prescreve micro RNAs regulatórios altamente específicos e outros fatores epigenéticos.
3. Portanto, a informação genética e epigenética vem de uma mente inteligente. Visto que não havia mente humana presente para criar vida, deve ter sido um agente sobrenatural.
A informação não é física
https://arxiv.org/pdf/1402.2414.pdf
A informação é uma entidade abstrata sem corpo, independente de seu portador físico. ”A informação está sempre ligada a uma representação física. É representado por uma gravação em uma placa de pedra, um giro, uma carga, um furo em um cartão perfurado, uma marca no papel ou algum outro equivalente. Isso vincula o manuseio da informação a todas as possibilidades e restrições de nossa palavra física real, suas leis da física e seu depósito ”. No entanto, as questões legítimas dizem respeito às propriedades físicas dos portadores de informação como “tábua de pedra, um giro, uma carga, um furo em um cartão perfurado, uma marca no papel”, mas não a informação em si. A informação não é clássica nem quântica, é independente das propriedades dos sistemas físicos usados para seu processamento.
Um algoritmo é uma sequência finita de instruções bem definidas e implementáveis por computador, resultando em funções pretendidas precisas. Um algoritmo prescritivo no contexto biológico pode ser descrito como realizando operações de controle usando regras, axiomas e instruções coerentes. Essas instruções são executadas, usando uma cadeia linear, digital e cibernética de símbolos que representam informações prescritivas sintáticas, semânticas e pragmáticas.
Três subconjuntos de complexidade de sequência e sua relevância para as informações biopoliméricas
https://link.springer.com/article/10.1186/1742-4682-2-29
Um algoritmo é uma sequência finita de instruções bem definidas e implementáveis por computador. Os algoritmos genéticos instruem uma organização biológica sofisticada. Existem três tipos qualitativos de complexidade de sequência: aleatória (RSC), ordenada (OSC) e funcional (FSC). O FSC sozinho fornece instrução algorítmica. Uma cadeia linear, digital e cibernética de símbolos que representam prescrição sintática, semântica e pragmática; cada sinal sucessivo na string é uma representação de uma configuração de chave configurável do nó de decisão - uma seleção específica para função. A seleção, especificação ou significação de certas "escolhas" nas sequências FSC resulta apenas da seleção não aleatória.
Os nucleotídeos são agrupados em códigos de bloco de Hamming triplos, cada um dos quais representa um determinado aminoácido. Não existe nenhuma ligação causal físico-química direta entre o códon e seu aminoácido simbolizado na maquinaria de tradução física. A física e a química não explicam por que o aminoácido "correto" fica na extremidade oposta do tRNA do anticódon apropriado. A física e a química não explicam como a aminoacil tRNA sintetase apropriada une um aminoácido específico apenas a um tRNA com o anticódon correto em sua extremidade oposta. Os genes não são análogos às mensagens; genes são mensagens. Genes são programas literais. Eles são enviados de uma fonte por um transmissor por meio de um canal. As sequências prescritivas são chamadas de "instruções" e "programas". Eles não são apenas sequências complexas. São sequências algorítmicas complexas. Eles são cibernéticos.
As capacidades do caos e da complexidade.
http://europepmc.org/article/PMC/2662469
Os sistemas de símbolos existem fora das mentes humanas?
A complexidade bidimensional da biologia molecular (estrutura biopolimérica secundária) e a complexidade tridimensional (estrutura biopolimérica terciária) são ambas, em última análise, determinadas pela complexidade da sequência linear (estrutura primária; complexidade da sequência funcional, FSC). A tabela de códons é arbitrária e formal, não física. A ligação de cada tRNA com o aminoácido correto depende inteiramente de uma família completamente independente de proteínas de tRNA aminoacil sintetase. Cada uma dessas sintetases deve ser prescrita especificamente por programação digital linear separada, mas usando o mesmo MSS. Esses sistemas de símbolos e códigos não apenas são anteriores à existência humana, mas também produziram humanos junto com suas mentes antropocêntricas.
A imagem acima mostra a codificação prescritiva de uma seção de DNA. Cada letra representa uma escolha de um alfabeto de quatro opções. O sequenciamento particular de escolhas de letras prescreve a sequência de códons tripletos e, finalmente, o sequenciamento traduzido de blocos de construção de aminoácidos em cadeias de proteínas. O sequenciamento de nucleotídeos no DNA também prescreve micro RNAs regulatórios altamente específicos e outros fatores epigenéticos. Assim, as instruções digitais lineares programam a proficiência metabólica cooperativa e holística.
O caos não é organizado nem um sistema verdadeiro, muito menos "auto-organizado". Um sistema genuíno requer organização. Por definição, o caos carece de organização. Que funções formais, por exemplo, um furacão executa? Ele não faz nada construtivo ou formalmente funcional porque não contém componentes organizacionais formais. Não tem talentos de programação ou instintos criativos. Um furacão não participa da Teoria da Decisão. Um furacão não define portas lógicas de acordo com regras arbitrárias de inferência. Um furacão não tem interruptores configuráveis desacoplados dinamicamente projetados especificamente. Não existe nenhum meio para instanciar escolhas formais ou função na fisicalidade. Um furacão altamente auto-ordenado não faz nada além de destruir a organização. Isso se aplica a quaisquer eventos naturais não guiados.
As capacidades de caos autônomo, complexidade, estados auto-ordenados, atratores naturais, fractais, passeios bêbados, sistemas adaptativos complexos e outros assuntos de modelos dinâmicos não lineares são frequentemente inflados. Mecanismo científico deve ser fornecido para como fenômenos puramente fisicodinâmicos podem programar nós de decisão, otimizar algoritmos, definir interruptores configuráveis de modo a atingir circuitos integrados, alcançar parada computacional e organizar reações químicas não relacionadas em um protometabolismo. Conhecemos apenas agentes conscientes ou inteligentes capazes de fornecer tais coisas.
Informação e a natureza da realidade da física à metafísica página 149
O conceito de informação foi vítima de um impasse filosófico que tem uma longa e contenciosa história: o problema de especificar o status ontológico das representações ou conteúdos de nossos pensamentos. Como pode o
o conteúdo (também conhecido como significado, referência, sobreidade significativa) de um signo ou pensamento tem qualquer eficácia causal no mundo se, por definição, não for intrínseco a qualquer objeto ou processo físico que o represente?
Considere o exemplo clássico de uma impressão de cera deixada por um anel de sinete em cera. Exceto para a mente que a interpreta, a impressão de cera é apenas cera, o anel é apenas uma forma metálica, e sua conjunção em um momento em que a cera ainda estava quente e maleável era apenas um evento físico em que um objeto altera outro quando eles são colocados em contato. Algo mais faz da impressão de cera um sinal que veicula informações. Deve ser interpretado por alguém.
Para desenvolver uma compreensão científica completa da informação, seremos obrigados a desistir de pensar sobre ela, mesmo metaforicamente, como algum artefato ou mercadoria. Para dar sentido à função representacional implícita que distingue a informação de outras relações meramente físicas, precisaremos encontrar uma maneira precisa de caracterizar sua característica não intrínseca definidora - seu conteúdo referencial - e mostrar como pode ser causalmente eficaz apesar de sua ausência física. O status enigmático dessa relação foi eloquentemente, embora enigmático, emoldurado pelo uso de Brentano do termo "inexistência" ao descrever fenômenos mentais.
Signature of the cell, Stephen Meyer página 16
O que os humanos reconhecem como informação certamente se origina do pensamento - da atividade consciente ou inteligente. Uma mensagem recebida via fax por uma pessoa surgiu primeiro como uma ideia na mente de outra. O software armazenado e vendido em um CD resultou do projeto de um engenheiro de software. As grandes obras da literatura começaram primeiro como idéias nas mentes dos escritores - Tolstoi, Austen ou Donne. Nossa experiência do mundo mostra que o que reconhecemos como informação invariavelmente reflete a atividade anterior de pessoas conscientes e inteligentes.
Agora sabemos que não apenas criamos informações em nossa própria tecnologia; também o encontramos em nossa biologia - e, de fato, nas células de todos os organismos vivos da Terra. Mas como surgiu essa informação? O antigo conflito entre as visões de mundo que priorizam a mente e a matéria em primeiro lugar atravessa o coração do mistério da origem da vida. A origem da vida pode ser explicada puramente por referência a processos materiais, como reações químicas não direcionadas ou colisões aleatórias de moléculas?
As origens algorítmicas da vida
https://royalsocietypublishing.org/doi/full/10.1098/rsif.2012.0869
A principal distinção entre a origem da vida e outras transições 'emergentes' é o início do controle da informação distribuída, permitindo a causação dependente do contexto, onde uma entidade sistêmica abstrata e não física (informação algorítmica) torna-se efetivamente um agente causal capaz de manipular seus substrato de material.
As informações biológicas são funcionais devido à sequência correta. Tem havido uma variedade de termos empregados para medir informações biológicas funcionais - informações complexas e específicas (CSI), Complexidade de sequência funcional (FSC), informações complexas de instrução. Gosto do termo instrucional porque define com precisão o que está sendo feito, a saber, instruir a sequência correta de aminoácidos para fazer proteínas, e também a sequência do RNA mensageiro, que é usado para a regulação do gene, e uma variedade de funções ainda não exploradas.
Outro termo é informação prescritiva (PI). Também descreve com precisão o que os genes fazem. Eles prescrevem como as proteínas devem ser montadas. Mas também contrabandeia um significado, que é altamente disputado entre os proponentes do design inteligente e da evolução não guiada. A prescrição implica que uma agência inteligente pré-ordenou a sequência de nucleotídeos para ser funcional. O seguinte documento declara:
A dicotomia na definição da informação prescritiva sugere tanto dados prescritos quanto algoritmos prescritos: aplicações da biosemiótica em sistemas genômicos
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3319427/
A informação biológica freqüentemente manifesta seu “significado” por meio de instrução ou produção real de biofunção formal. Essas informações são chamadas de Informações Prescritivas (PI). Os programas PI organizam e executam um conjunto prescrito de escolhas. Um exame mais detalhado desse termo em sistemas celulares levou a uma dicotomia em sua definição, sugerindo que tanto os dados prescritos quanto os algoritmos prescritos são constituintes do IP. Este artigo analisa essa dicotomia expressa tanto no código genético quanto no dogma central da síntese de proteínas. Um exemplo de um algoritmo genético é modelado após o ribossomo, e um exame do processo de síntese de proteínas é usado para diferenciar os dados de PI dos algoritmos de PI.
Tanto o método usado para combinar vários genes para produzir uma máquina molecular quanto a lógica operacional da máquina são exemplos de um algoritmo. As máquinas moleculares são um produto de vários conjuntos de instruções de policodonte (genes) e podem ser operadas algoritmicamente. Mas qual processo determina qual algoritmo executar?
Além da execução do algoritmo, deve haver um algoritmo de montagem. Qualquer engenheiro de manufatura sabe que nada (na produção) é construído sem planos que definam com precisão as ordens de operações para montar de maneira adequada e econômica os componentes para construir uma máquina ou produto. Deve haver, por necessidade, uma ordem de operações para construir máquinas biológicas. Isso ocorre porque as máquinas biológicas não são caóticas nem aleatórias, mas são conjuntos funcionalmente coerentes de proteínas / elementos de RNA. Um conjunto de operações que governam a construção de tais conjuntos pode existir como um algoritmo que precisamos descobrir. Ele detalha os processos biológicos reais que são operados por um conjunto de regras que definem a construção dos elementos biológicos tanto em uma sequência de montagem temporal quanto física.
Um algoitmo é um conjunto de regras ou procedimentos que define com precisão uma sequência finita de operações. Essas instruções prescrevem um cálculo ou ação que, quando executada, prosseguirá por meio de um número finito de estados bem definidos que leva a resultados específicos. Neste contexto, um algoritmo pode ser representado como: Algoritmo = lógica + controle; onde o componente lógico expressa regras, operações, axiomas e instruções coerentes. Essas instruções podem ser usadas no cálculo e controle, enquanto os componentes de tomada de decisão determinam a maneira pela qual a dedução é aplicada aos axiomas de acordo com as regras conforme se aplica às instruções.
Um ribossomo é uma máquina biológica que consiste em cerca de 200 proteínas (fatores de montagem) que auxiliam nas operações de montagem, juntamente com 4 moléculas de RNA e 78 proteínas ribossômicas que compõem um ribossomo maduro. Este complexo de proteínas e RNAs produzem coletivamente uma nova função que é maior do que a funcionalidade individual das proteínas e RNAs que o compõem.
O DNA (dados de origem), RNA (mRNA editado), componentes grandes e pequenos de RNA do RNA ribossomal, proteína ribossômica, tRNA, enzimas aminoacil-tRNA sintetase e proteína "manufaturada" (saída de ribossomo) fazem parte desta forma irreversível ponte contida no dogma central da biologia molecular.
Um dos maiores enigmas da biologia molecular é como a programação digital linear codônica não só é capaz de antecipar o que será o dobramento de energia livre de Gibbs, mas na verdade prescreve esse dobramento eventual por meio de seu sequenciamento de aminoácidos. Da mesma forma que um engenheiro humano, o PI formal não físico instanciado na prescrição de códon digital linear faz uso de realidades físicas como a termodinâmica para produzir as máquinas moleculares globulares necessárias.
O funcionamento funcional do ribossomo consiste em estruturas lógicas e controle que obedece às regras de um algoritmo. O elemento mais simples da estrutura lógica em um algoritmo é uma sequência linear. Uma sequência linear consiste em uma instrução ou dado, seguido imediatamente por outro, como fica evidente no arranjo linear dos códons que constituem os genes do DNA.
O mRNA (que é ele próprio um produto da cópia do gene e da sub-rotina do editor) é uma entrada necessária que é formatada por regras gramaticais.
Causação de cima para baixo por controle de informação: de um problema filosófico a um programa de pesquisa científica
https://sci-hub.st/https://royalsocietypublishing.org/doi/10.1098/rsif.2008.0018
https://elohim.catsboard.com/t347-as-origens-algoritmicas-da-vida
Em Inglês:
https://reasonandscience.catsboard.com/t3061-the-algorithmic-origins-of-life
Chance de encontrar uma mensagem escrita em uma nuvem no céu: "Jesus te ama" aleatoriamente, é como o DNA criando seu próprio software e, sobre ele, escrevendo um algoritmo complexo para fazer uma proteína por acidente.
1. Algoritmos, prescrição de instruções funcionais, programação digital, uso de símbolos e sistemas de codificação são abstratos e não físicos, e sempre se originam do pensamento - da atividade consciente ou inteligente.
2. A informação genética e epigenética é caracterizada por conter informação prescritiva codificada, que resulta em resultados funcionais devido à sequência complexa específica certa de códons tripletos e, finalmente, o sequenciamento traduzido de blocos de construção de aminoácidos em cadeias de proteínas. O sequenciamento de nucleotídeos no DNA também prescreve micro RNAs regulatórios altamente específicos e outros fatores epigenéticos.
3. Portanto, a informação genética e epigenética vem de uma mente inteligente. Visto que não havia mente humana presente para criar vida, deve ter sido um agente sobrenatural.
A informação não é física
https://arxiv.org/pdf/1402.2414.pdf
A informação é uma entidade abstrata sem corpo, independente de seu portador físico. ”A informação está sempre ligada a uma representação física. É representado por uma gravação em uma placa de pedra, um giro, uma carga, um furo em um cartão perfurado, uma marca no papel ou algum outro equivalente. Isso vincula o manuseio da informação a todas as possibilidades e restrições de nossa palavra física real, suas leis da física e seu depósito ”. No entanto, as questões legítimas dizem respeito às propriedades físicas dos portadores de informação como “tábua de pedra, um giro, uma carga, um furo em um cartão perfurado, uma marca no papel”, mas não a informação em si. A informação não é clássica nem quântica, é independente das propriedades dos sistemas físicos usados para seu processamento.
Um algoritmo é uma sequência finita de instruções bem definidas e implementáveis por computador, resultando em funções pretendidas precisas. Um algoritmo prescritivo no contexto biológico pode ser descrito como realizando operações de controle usando regras, axiomas e instruções coerentes. Essas instruções são executadas, usando uma cadeia linear, digital e cibernética de símbolos que representam informações prescritivas sintáticas, semânticas e pragmáticas.
Três subconjuntos de complexidade de sequência e sua relevância para as informações biopoliméricas
https://link.springer.com/article/10.1186/1742-4682-2-29
Um algoritmo é uma sequência finita de instruções bem definidas e implementáveis por computador. Os algoritmos genéticos instruem uma organização biológica sofisticada. Existem três tipos qualitativos de complexidade de sequência: aleatória (RSC), ordenada (OSC) e funcional (FSC). O FSC sozinho fornece instrução algorítmica. Uma cadeia linear, digital e cibernética de símbolos que representam prescrição sintática, semântica e pragmática; cada sinal sucessivo na string é uma representação de uma configuração de chave configurável do nó de decisão - uma seleção específica para função. A seleção, especificação ou significação de certas "escolhas" nas sequências FSC resulta apenas da seleção não aleatória.
Os nucleotídeos são agrupados em códigos de bloco de Hamming triplos, cada um dos quais representa um determinado aminoácido. Não existe nenhuma ligação causal físico-química direta entre o códon e seu aminoácido simbolizado na maquinaria de tradução física. A física e a química não explicam por que o aminoácido "correto" fica na extremidade oposta do tRNA do anticódon apropriado. A física e a química não explicam como a aminoacil tRNA sintetase apropriada une um aminoácido específico apenas a um tRNA com o anticódon correto em sua extremidade oposta. Os genes não são análogos às mensagens; genes são mensagens. Genes são programas literais. Eles são enviados de uma fonte por um transmissor por meio de um canal. As sequências prescritivas são chamadas de "instruções" e "programas". Eles não são apenas sequências complexas. São sequências algorítmicas complexas. Eles são cibernéticos.
As capacidades do caos e da complexidade.
http://europepmc.org/article/PMC/2662469
Os sistemas de símbolos existem fora das mentes humanas?
A complexidade bidimensional da biologia molecular (estrutura biopolimérica secundária) e a complexidade tridimensional (estrutura biopolimérica terciária) são ambas, em última análise, determinadas pela complexidade da sequência linear (estrutura primária; complexidade da sequência funcional, FSC). A tabela de códons é arbitrária e formal, não física. A ligação de cada tRNA com o aminoácido correto depende inteiramente de uma família completamente independente de proteínas de tRNA aminoacil sintetase. Cada uma dessas sintetases deve ser prescrita especificamente por programação digital linear separada, mas usando o mesmo MSS. Esses sistemas de símbolos e códigos não apenas são anteriores à existência humana, mas também produziram humanos junto com suas mentes antropocêntricas.
A imagem acima mostra a codificação prescritiva de uma seção de DNA. Cada letra representa uma escolha de um alfabeto de quatro opções. O sequenciamento particular de escolhas de letras prescreve a sequência de códons tripletos e, finalmente, o sequenciamento traduzido de blocos de construção de aminoácidos em cadeias de proteínas. O sequenciamento de nucleotídeos no DNA também prescreve micro RNAs regulatórios altamente específicos e outros fatores epigenéticos. Assim, as instruções digitais lineares programam a proficiência metabólica cooperativa e holística.
O caos não é organizado nem um sistema verdadeiro, muito menos "auto-organizado". Um sistema genuíno requer organização. Por definição, o caos carece de organização. Que funções formais, por exemplo, um furacão executa? Ele não faz nada construtivo ou formalmente funcional porque não contém componentes organizacionais formais. Não tem talentos de programação ou instintos criativos. Um furacão não participa da Teoria da Decisão. Um furacão não define portas lógicas de acordo com regras arbitrárias de inferência. Um furacão não tem interruptores configuráveis desacoplados dinamicamente projetados especificamente. Não existe nenhum meio para instanciar escolhas formais ou função na fisicalidade. Um furacão altamente auto-ordenado não faz nada além de destruir a organização. Isso se aplica a quaisquer eventos naturais não guiados.
As capacidades de caos autônomo, complexidade, estados auto-ordenados, atratores naturais, fractais, passeios bêbados, sistemas adaptativos complexos e outros assuntos de modelos dinâmicos não lineares são frequentemente inflados. Mecanismo científico deve ser fornecido para como fenômenos puramente fisicodinâmicos podem programar nós de decisão, otimizar algoritmos, definir interruptores configuráveis de modo a atingir circuitos integrados, alcançar parada computacional e organizar reações químicas não relacionadas em um protometabolismo. Conhecemos apenas agentes conscientes ou inteligentes capazes de fornecer tais coisas.
Informação e a natureza da realidade da física à metafísica página 149
O conceito de informação foi vítima de um impasse filosófico que tem uma longa e contenciosa história: o problema de especificar o status ontológico das representações ou conteúdos de nossos pensamentos. Como pode o
o conteúdo (também conhecido como significado, referência, sobreidade significativa) de um signo ou pensamento tem qualquer eficácia causal no mundo se, por definição, não for intrínseco a qualquer objeto ou processo físico que o represente?
Considere o exemplo clássico de uma impressão de cera deixada por um anel de sinete em cera. Exceto para a mente que a interpreta, a impressão de cera é apenas cera, o anel é apenas uma forma metálica, e sua conjunção em um momento em que a cera ainda estava quente e maleável era apenas um evento físico em que um objeto altera outro quando eles são colocados em contato. Algo mais faz da impressão de cera um sinal que veicula informações. Deve ser interpretado por alguém.
Para desenvolver uma compreensão científica completa da informação, seremos obrigados a desistir de pensar sobre ela, mesmo metaforicamente, como algum artefato ou mercadoria. Para dar sentido à função representacional implícita que distingue a informação de outras relações meramente físicas, precisaremos encontrar uma maneira precisa de caracterizar sua característica não intrínseca definidora - seu conteúdo referencial - e mostrar como pode ser causalmente eficaz apesar de sua ausência física. O status enigmático dessa relação foi eloquentemente, embora enigmático, emoldurado pelo uso de Brentano do termo "inexistência" ao descrever fenômenos mentais.
Signature of the cell, Stephen Meyer página 16
O que os humanos reconhecem como informação certamente se origina do pensamento - da atividade consciente ou inteligente. Uma mensagem recebida via fax por uma pessoa surgiu primeiro como uma ideia na mente de outra. O software armazenado e vendido em um CD resultou do projeto de um engenheiro de software. As grandes obras da literatura começaram primeiro como idéias nas mentes dos escritores - Tolstoi, Austen ou Donne. Nossa experiência do mundo mostra que o que reconhecemos como informação invariavelmente reflete a atividade anterior de pessoas conscientes e inteligentes.
Agora sabemos que não apenas criamos informações em nossa própria tecnologia; também o encontramos em nossa biologia - e, de fato, nas células de todos os organismos vivos da Terra. Mas como surgiu essa informação? O antigo conflito entre as visões de mundo que priorizam a mente e a matéria em primeiro lugar atravessa o coração do mistério da origem da vida. A origem da vida pode ser explicada puramente por referência a processos materiais, como reações químicas não direcionadas ou colisões aleatórias de moléculas?
As origens algorítmicas da vida
https://royalsocietypublishing.org/doi/full/10.1098/rsif.2012.0869
A principal distinção entre a origem da vida e outras transições 'emergentes' é o início do controle da informação distribuída, permitindo a causação dependente do contexto, onde uma entidade sistêmica abstrata e não física (informação algorítmica) torna-se efetivamente um agente causal capaz de manipular seus substrato de material.
As informações biológicas são funcionais devido à sequência correta. Tem havido uma variedade de termos empregados para medir informações biológicas funcionais - informações complexas e específicas (CSI), Complexidade de sequência funcional (FSC), informações complexas de instrução. Gosto do termo instrucional porque define com precisão o que está sendo feito, a saber, instruir a sequência correta de aminoácidos para fazer proteínas, e também a sequência do RNA mensageiro, que é usado para a regulação do gene, e uma variedade de funções ainda não exploradas.
Outro termo é informação prescritiva (PI). Também descreve com precisão o que os genes fazem. Eles prescrevem como as proteínas devem ser montadas. Mas também contrabandeia um significado, que é altamente disputado entre os proponentes do design inteligente e da evolução não guiada. A prescrição implica que uma agência inteligente pré-ordenou a sequência de nucleotídeos para ser funcional. O seguinte documento declara:
A dicotomia na definição da informação prescritiva sugere tanto dados prescritos quanto algoritmos prescritos: aplicações da biosemiótica em sistemas genômicos
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3319427/
A informação biológica freqüentemente manifesta seu “significado” por meio de instrução ou produção real de biofunção formal. Essas informações são chamadas de Informações Prescritivas (PI). Os programas PI organizam e executam um conjunto prescrito de escolhas. Um exame mais detalhado desse termo em sistemas celulares levou a uma dicotomia em sua definição, sugerindo que tanto os dados prescritos quanto os algoritmos prescritos são constituintes do IP. Este artigo analisa essa dicotomia expressa tanto no código genético quanto no dogma central da síntese de proteínas. Um exemplo de um algoritmo genético é modelado após o ribossomo, e um exame do processo de síntese de proteínas é usado para diferenciar os dados de PI dos algoritmos de PI.
Tanto o método usado para combinar vários genes para produzir uma máquina molecular quanto a lógica operacional da máquina são exemplos de um algoritmo. As máquinas moleculares são um produto de vários conjuntos de instruções de policodonte (genes) e podem ser operadas algoritmicamente. Mas qual processo determina qual algoritmo executar?
Além da execução do algoritmo, deve haver um algoritmo de montagem. Qualquer engenheiro de manufatura sabe que nada (na produção) é construído sem planos que definam com precisão as ordens de operações para montar de maneira adequada e econômica os componentes para construir uma máquina ou produto. Deve haver, por necessidade, uma ordem de operações para construir máquinas biológicas. Isso ocorre porque as máquinas biológicas não são caóticas nem aleatórias, mas são conjuntos funcionalmente coerentes de proteínas / elementos de RNA. Um conjunto de operações que governam a construção de tais conjuntos pode existir como um algoritmo que precisamos descobrir. Ele detalha os processos biológicos reais que são operados por um conjunto de regras que definem a construção dos elementos biológicos tanto em uma sequência de montagem temporal quanto física.
Um algoitmo é um conjunto de regras ou procedimentos que define com precisão uma sequência finita de operações. Essas instruções prescrevem um cálculo ou ação que, quando executada, prosseguirá por meio de um número finito de estados bem definidos que leva a resultados específicos. Neste contexto, um algoritmo pode ser representado como: Algoritmo = lógica + controle; onde o componente lógico expressa regras, operações, axiomas e instruções coerentes. Essas instruções podem ser usadas no cálculo e controle, enquanto os componentes de tomada de decisão determinam a maneira pela qual a dedução é aplicada aos axiomas de acordo com as regras conforme se aplica às instruções.
Um ribossomo é uma máquina biológica que consiste em cerca de 200 proteínas (fatores de montagem) que auxiliam nas operações de montagem, juntamente com 4 moléculas de RNA e 78 proteínas ribossômicas que compõem um ribossomo maduro. Este complexo de proteínas e RNAs produzem coletivamente uma nova função que é maior do que a funcionalidade individual das proteínas e RNAs que o compõem.
O DNA (dados de origem), RNA (mRNA editado), componentes grandes e pequenos de RNA do RNA ribossomal, proteína ribossômica, tRNA, enzimas aminoacil-tRNA sintetase e proteína "manufaturada" (saída de ribossomo) fazem parte desta forma irreversível ponte contida no dogma central da biologia molecular.
Um dos maiores enigmas da biologia molecular é como a programação digital linear codônica não só é capaz de antecipar o que será o dobramento de energia livre de Gibbs, mas na verdade prescreve esse dobramento eventual por meio de seu sequenciamento de aminoácidos. Da mesma forma que um engenheiro humano, o PI formal não físico instanciado na prescrição de códon digital linear faz uso de realidades físicas como a termodinâmica para produzir as máquinas moleculares globulares necessárias.
O funcionamento funcional do ribossomo consiste em estruturas lógicas e controle que obedece às regras de um algoritmo. O elemento mais simples da estrutura lógica em um algoritmo é uma sequência linear. Uma sequência linear consiste em uma instrução ou dado, seguido imediatamente por outro, como fica evidente no arranjo linear dos códons que constituem os genes do DNA.
O mRNA (que é ele próprio um produto da cópia do gene e da sub-rotina do editor) é uma entrada necessária que é formatada por regras gramaticais.
Causação de cima para baixo por controle de informação: de um problema filosófico a um programa de pesquisa científica
https://sci-hub.st/https://royalsocietypublishing.org/doi/10.1098/rsif.2008.0018